Proiektu hau, gene espezifikoak dituzten bakteriak inaktibatzeko CRISPR-Cas9 teknologiaren erabileran oinarritzen da, matrize konplexuetan aplikatuta. Antibiotikoekiko erresistentziaren arazo handiagoak, ingurune ezberdinetan komunitate mikrobianoak modu espezifikoan manipulatzeko beharrak (elikagaietan, hesteetako mikrobioman edo ingurumen-laginetan), metodo alternatibo eta zehatzagoen bilaketa bultzatzen dute. CRISPR-Cas9 teknologia, duela gutxi aurkitutako bakterioen immunitate moldakorraren sistema den heinean, gaitasun handia du bakterioetan gene diana zehatzak editatu edo ezabatzeko. Proiektu honen helburua, CRISPR-Cas9 sistemak diseinatzea, entregatzea eta balidatzea, bakterio-aberastasun handiko inguruneetan hautatutako bakterietara zuzenduta, eta horien aplikazioa baldintza ez-kontrolatuetan hobeto ulertzea. Ikerketa honen emaitzek oinarri sendoa eman dezakete ikerketa eta bioteknologia-aplikazioetarako tresna moldakor baten garapenerako.

• Leartiker

• gRNA espezifikoen diseinua eta optimizazioa.
• Analisi bioinformatikoak eta genoma osoaren sekuentziazioa (WGS) cepa garrantzitsuenetan.
• CRISPR-Cas9 sistemaren entrega-metodoen ebaluazioa bakterioetan, tartean shock termikoa eta beste hurbilketa batzuk.
• Plasmido CRISPR funtzionalen eraikuntza.
• In vitro saiakuntzak eta lehen probak esne-matrizeetan (esne pasteurizatua eta gordinak).
• Enterotoxinen ekoizpenean eraginaren analisia eta sistemaren zehaztasunaren balorazioa.